Assumiu a Presidência da Câmara de Faro, no mandato de Macário Correia, que entretanto saiu, por motivos ligados a questões judiciais.
Nessa altura Rogério Bacalhau que desempenhava o cargo de Vice-Presidente, passou a liderar o Município.
Depois de ter ganho as eleições autárquicas de 2013, apostou num segundo mandato em 2017 e ganhou frente ao candidato do PS, António Eusébio.
Professor de matemática e gestor escolar de profissão, Rogério Bacalhau afirma que, “Faro é o Concelho em que vivo desde os 6 anos. Aqui constitui a minha família, criei os meus filhos e desenvolvi a minha carreira profissional.”
A 26 de setembro de 2021, ganhou um terceiro mandato como Presidente da Câmara de Faro, nas eleições autárquicas, com 47,76% dos votos, contra João Marques do PS que obteve 30,58%.